Uchiha Itachi & Hoshigaki Kisame – a primeira dupla da Akatsuki a aparecer, antes mesmo da série revelar quaisquer informações relevantes sobre a organização. Os dois parecem trabalhar em harmonia - nunca foi mostrado nenhum atrito ou desavença entre eles. No entanto, Itachi demonstra ter alguma autoridade sobre Kisame, que normalmente segue as instruções do colega imediatamente. O trabalho em equipe é notável, superando as diferenças entre as personalidades, ambições e estilo de luta de ambos.
Orochimaru & Akasuna no Sasori – antes do início da série, o Sannin e o mestre das marionetes formavam uma dupla. Foi, inclusive, Sasori quem “deu” Yakushi Kabuto para o ex-colega (e depois usou o iryuunin como espião para a Akatsuki, acreditando que ainda tinha um jutsu de controle mental sobre Kabuto).
Akasuna no Sasori & Deidara – com a deserção de Orochimaru, coube a Deidara substituí-lo. Os dois viviam em atrito: Sasori era muito rígido em relação à pontualidade (odiava que os outros o fizessem esperar), ao contrário da personalidade despreocupada de Deidara. Também tinham uma série divergência em relação à arte, já que Sasori achava que arte era algo que deveria durar eternamente (como suas marionetes), enquanto Deidara achava que arte deveria ser algo belo e efêmero (como suas explosões).
Deidara & Tobi – com a morte de Sasori, Tobi finalmente pôde fazer parte da Akatsuki (tomando o lugar do mestre de marionetes e seu anel, Tama). Em sua companhia, Deidara paga por todas as vezes que irritou Sasori: Tobi age como um bobo alegre, não mede as palavras e em geral consegue tirar o colega do sério com muita facilidade.
Hidan & Kakuzu – essa dupla foi apelidada de “Os Imortais” pelos fãs da série, já que os dois personagens possuíam técnicas que os tornavam quase indestrutíveis. De fato, foi essa “imortalidade” que permitiu Hidan sobreviver tanto tempo ao lado de Kakuzu, que ameaçava o colega de morte a toda hora. Hidan era passional, bastante “devoto” à sua religião, e Kakuzu era calculista, completamente movido a dinheiro; enfim, a dupla brigava freqüentemente
Pein & Konan: A última dupla a aparecer contém a única mulher da organização. Os dois agem em sincronia um com o outro, por Konan ser submissa às ordens de Pain, e pelo fato dos dois serem completamente focados em um objetivo em comum. Outra coisa me comum entre ambos é o fato de serem antigos alunos de Jiraya, junto com Yahiko. O nome verdadeiro de Pein é Nagato, sendo ele o suposto líder da Akatsuki, porém, mais a frente, é mostrado que Pein responde a uma outra pessoa, e mais a frente... Bom, vamos parar por aqui. Afinal, vou deixar você descobrir sozinho, vendo o animê.
Zetsu: Zetsu é o único membro da Akatsuki que trabalha sozinho. O trabalho dele é de eliminar os vestigios de corpos, recuperar o anel de algum membro morto e espionagem. Zetsu tem a forma de uma planta carnívora, o que sugere que ele devora os corpos mortos. Ele possui o rosto dividido em duas cores: um lado é branco e o outro é preto, o que sugere que ele tenha dupla personalidade. Foi Zetsu que, junto com Tobi, descobriu o corpo morto de Sassori, e quando Tobi perguntou se já poderia ser da Akatsuki, já que segurava o anel de Sassori, Zetsu respondeu que tem que fazer mais do que usar um anel para ser da Akatsuki, mas que Tobi era "um bom garoto".
